原属考城。
清乾隆四十八年（1783）划归睢州。
1912年属睢县。
1928年划归民权县，属孙六区吴屯联保。
1948年属孙六区，在此设吴屯乡。
1956年属王庄寨乡，称吴屯高级农业生产合作社。
1958年属孙六人民公社，称吴屯生产大队。
1961年属孙六区。
1963年属林七区。
1965年属孙六公社。
1969年属王庄寨公社，称吴屯生产大队。
1983年属王庄寨乡，称吴屯村民委员会。
2009年属王庄寨镇，称吴屯村民委员会至今。