东汉永建四年（129），析剡县北合上虞县南，置始宁县，县治设今三界镇，隋开皇九年（589）废。
大业元年（605），复置始宁县，唐武德八年（625）又废，原始宁县领域仍归旧属。
贞元二十年（804），洪水冲毁官巷而成江河，街巷移建至城隍庙前。
宋时置三界镇，属会稽县，与嵊县、上虞交界，故名。
元设驿站。
明成化八年（1472）由会稽县划入嵊县至今。
万历年间（1573~1619）设市。
1926年镇上发生大火，始宁街焚毁殆尽，崇仁巨商金宪章出资重建。
新街全长930米，均系砖木结构楼房，高低一致，格式统一。
21年复置镇，37年改乡。
1949年建立三界区，辖三界乡、蒋桥乡、灵芝乡、四德乡。
1954年4月，绍兴县八郑乡、德政乡划入。
1956年13个乡合并为5个乡，并三界和下市头村另建三界镇。
1981年省人民政府批准置三界镇，隶属三界区。
1992年江东乡、三合乡、福源乡并入三界镇，西杜乡并入友谊乡。
1993年蒋镇乡改置镇。
2001年12月蒋镇、友谊乡并入三界镇。