明洪武十四年（1381）定遂昌为4乡22都，王村口属保义乡二十都。
清乾隆年间（1736～1795），遂昌设5乡22都，王村口属西乡二十都；宣统三年（1911），实行地方自治，县设10个自治区，王村口属保礼区。
民国初，沿袭清末旧制；17年（1928）推行村里制，称王村口里，属保礼区；19年（1930）4月，村里改乡镇，称王村口镇，属第五区；23年（1934）12月，推行保甲制，王村口镇下辖8保，75甲；29年（1940年）10月，实行新县制，对山乡并入，全镇共辖8保80甲；35年（1946年）9月，王村口改镇为乡。
1949年沿称王村口乡。
1950年10月，调整行政区划，王村口乡分为王村口和对山2乡，王村口乡下辖6个村，对山乡下辖5个村。
1956年，对山乡的4个村并入王村口乡。
1958年9月，撤销区级建制，王村口乡改称王村口生产大队。
1959年2月，改称王村口管理区。
1961年7月，又改称为王村口人民公社，属王村口区；同年，关川人民公社尹坞大队垵下村划入。
1983年6月，政社分设，复称王村口乡。
1984年11月，王村口乡分设王村口、对正2乡。
1989年5月，复称王村口镇，属王村口区。
1992年5月，撤区并乡，对正、关川2乡并入王村口镇，镇政府驻地自桥西村迁原王村口区公社驻地桥东村。
全镇辖1居、24村。
2010年12月，全县进行村规模调整，调整后辖1居13村。