明嘉靖年间属南社乡十三都、十五都；1931年建有飞云、南社、中宝、卓峰等乡，属第二区；1938年飞云乡与南社乡合并为云南乡；1946年与宝峰乡（系中宝、卓峰乡合并而成）合并，称云峰乡，属仙降区；1949年8月置吴桥、孙桥乡，属仙降区；1958年9月改称吴桥、孙桥生产大队（1959年3月改为吴桥、孙桥管理区），属海滨（仙降）公社；1961年9月改建吴桥、孙桥人民公社，属仙降区；1984年复置吴桥、孙桥乡，1985年12月撤吴桥乡置飞云镇，仍属仙降区；1992年5月撤区后与孙桥乡合置飞云镇；2000年6月与林垟镇、阁巷镇、云周乡合置飞云镇；2011年4月撤飞云镇，分置飞云、南滨2个街道；2015年12月从飞云街道析置云周街道。