中余乡辖区在清季属兴贤乡；解放前属平湖区兴仁乡；1949年5月全县解放，为马剑区兴仁乡，次年10月建为中余，佛堂，蒲阳三乡，1956年合并为中余乡；1958年10月以区建社，为普丰公社中余管理区；1960年1月浦江县并入义乌县时为浦江公社中余大队；1961年7月为普丰区中余人民公社；1967年1月恢复浦江县后公社直属于县；1980年9月恢复区建制，属平湖区；1983年8月政社分设改为中余乡，驻地中余。