现村域在南宋淳熙十二年（1185）属寿昌乡；宋末推行都图制后属十都；清雍正六年（1728）属商家庄；民国三十年（1941）属石屏乡。
解放初为石屏乡第一、第二、第三村，1950年划建小乡后分属石屏乡、南山乡。
1983年12月政社分设后，分别组建商家、下官山、寺墈头、毛家等4个村的村民委员会，属石屏乡人民政府领导，2005年4月起属航头镇政府领导，2007年7月四村合并，取名灵栖村，组建村民委员会开展基层自治管理和服务。
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