更楼街道现域，按南宋淳熙《严州图经》记载，其时（1174—1189）为寿昌县仁丰乡、建德县建德乡的属地；宋末推行都图制后，为寿昌县一都、十二都和建德县十二都的属地；清雍正六年（1728）为寿昌县仁丰乡石岭、过塘、燕山、湖岑、厚堂、骆村、新市、淤堨、新街等庄和建德县建德乡西小洋庄属地。
1912年，为寿昌县仁丰区、建德两个县亲睦区属地。
1932年，设更楼镇。
1935年完成乡镇整顿后，为寿昌县更楼镇（1936年并乡后设为仁丰镇）及双源、利涉、三湖、乐岭、绿溪乡及建德县甘源乡属地。
解放前后，该地域属寿昌县仁丰镇、七里乡，建德县殿后乡、西洋乡属地。
1950年划建小乡后，为更楼、东林、沽塘、淤堨乡及邓家乡（同年8月设置）属地。
1956年并乡后，为更楼乡、沽塘乡（1958年9月部分划属兰溪县）。
1958年底属新安江公社。
1961年7月设置更楼、沽塘（1966年改称邓家）两个公社。
1983年分别改设乡。
1985年5月，更楼撤乡建镇。
1992年，更楼镇撤销，并入新设的新安江镇。
2001年10月，新安江镇、邓家乡建制撤销，原新安江镇南部和原邓家乡的28个建制村、2个居民区合并新设更楼街道。