清代部分村落已建村。
1737年始归属丽江府吉尾、山后约，清晚期属丽江县山后里。
1912年兰坪设治之初，划归西新化里。
1921年属第五区西新化里，属梭罗寨村。
1933年推行区、乡镇自治，设第三区文明乡，治所设今恩棋村委会知其位（今改称恩棋村），为闾、邻建制。
1938年改为保甲制。
1940年全面推行乡镇保甲建制，将梭罗寨、知其位2个村编为石宝乡第六保，直至解放初。
1953年划区乡政权时，以石宝乡第六保为区域成立第四区恩棋乡。
1958年下半年公社化时期属营盘人民公社恩棋管理区，基本以村为单元组建生产队。
1962年4月归属第四区营盘片，为恩棋公社，1967年11月划编为营盘区革命委员会恩棋人民公社。
1969年1月更名为营盘公社革命委员会恩棋大队。
1984年2月设区建乡，成立营盘区恩棋乡人民政府。
1987年12月撤销区的建制，实行乡镇制，设立营盘镇恩棋办事处，原生产队改称生产合作社。
2000年12月“村改委”改称恩棋村民委员会，自得名后沿用至今。