民国时期属三元乡第7保；建国后1951年建政为三元乡第7村；1955年建社为三元乡胜利社；1958年为三元公社六管理区；1962年为三元公社八大队；1967年改为红日公社八大队；1981年地名普查命名为三元公社石笋大队；1984年为三元乡石笋村；1992年撤区并乡后为三元乡石笋村。
2019年，根据川府民政[2019]9号文件批准，划归太蓬乡管辖。
2020年，村级建制调整，撤销长渠村和石笋村，合并设立石笋村（营府函〔2020〕72号）。