解放前为盘龙乡2保。
解放后1952年民主建政为群乐乡4村，1958年为红日公社21管理区，1961年编为群乐公社7大队，1983年公社改乡为群乐乡石碓窝村。
1992年9月撤销群乐乡，石碓窝村划归巨龙镇管辖，为巨龙镇石碓窝村。
1994年7月撤群乐乡复建群乐乡，为群乐乡石碓窝村。
2019年，行政区划调整，将碓窝村划归巨龙镇管辖。
2020年，村级建制调整，撤销石难窝村、玉宝山村，合并设立石碓窝村（蓬安府发〔2020〕6号）。