会东县建县前，今堵格镇境域属会理县鲹鱼区鱼格乡。
1952年7月，析会理县、巧家县设立会东县；境内分别设立堵格乡、火山乡、坪塘乡，均属会东县新堵区。
1955年，撤销新堵区，堵格乡、火山乡、坪塘乡划归鲹鱼区。
1958年，撤乡改公社，原堵格乡、火山乡合并设立堵格人民公社，原坪塘乡改设为坪塘人民公社。
1966年，堵格人民公社更名为红旗人民公社，坪塘人民公社更名为上游人民公社。
1981年，由红旗人民公社分设为火山人民公社、堵格人民公社，上游人民公社复名坪塘人民公社。
1984年，撤销堵格人民公社、火山人民公社、坪塘人民公社，设立堵格乡、火山乡、坪塘乡。
2013年6月，撤销堵格乡、火山乡、坪塘乡，设立堵格镇，辖原堵格乡、火山乡、坪塘乡行政区域。