1949年解放初属一区，新庙乡。
1953年属一区西窑沟乡，称北元行政村。
1956年撤区划乡，属西窑沟乡，并建立农业生产合作社，称北元农业生产合作社。
1958年4月成立人民公社，属西窑沟人民公社，称北元大队，为独村大队。
1958年9月建立大公社属长城人民公社，仍称大队。
1958年左云、右玉两县合并，属左云县长城人民公社，称大队。
1984年9月建立城关镇，同时成立北元村民委员会至今。
2001年撤乡并镇，隶属右卫镇，仍称北元村民委员会。