畖底、薛店、、阳隅俗称北垣。
1943年，设立稷麓县，北垣西部划归稷麓二区。
1945年，畖底属绛南县，1947年，属五区政府，设四区民主政府西畖底行政村。
1948年10月，绛南县撤销，北垣划归闻喜。
1949年10月，五区辖现畖底镇、薛店镇、阳隅乡，惯称为北垣四十八个村。
1953年，设五区人民政府西畖底行政村，分属五区东颜、西畖底、栗村、东雷阳、回坑、阳隅。
1954年，区级机构撤销，北垣八个乡合并为畖底、薛店两个乡。
1958年，东畖底、中畖底、西畖底属北垣人民公社。
1961年，畖底从北垣公社划出，成立畖底人民公社。
1984年，根据省政府（84）晋政函79号文，更名为畖底镇。