石口古称石阿城，《史记•赵世家》记载：成侯十一年(前339）“秦功魏，赵救之功石阿”。
春秋时期，石口为晋属蒲地，晋文公重耳曾封于蒲，即在今石口乡蒲依村。
汉初属蒲子县，北魏属岭东县，后属新城县，唐时属温泉县和高唐县，五代、宋、金未变。
元至元三年(1337)归县，直至明、清、民国，归属基本不变。
新中国成立后属临汾专区。
1958年设石口人民公社和川口人民公社。
1971年4月归新成立的交口县。
1984年分设为石口乡和川口乡。
2001年4月又合并为石口乡。
2021年2月依据《山西省人民政府关于同意吕梁市辖区调整的批复》，撤销石口乡，设立石口镇。