北洋军阀政府时期（1912~1928）马坡属山东省济宁市邹县，国民党政府时期（1929～1949），马坡属山东省第一行政区邹县。
抗日战争及解放战争时期，1939年，邹县建立（属中共邹滕峄工委领导，5月改属苏鲁豫特区辖的湖边专区）。
马坡属邹西县。
1941年1月，邹西、滕西县撤销，改建为湖东县（属鲁南行政第一专区）。
马坡属湖东县。
1944年10月，撤销湖东县，改建为凫山县，马坡属凫山县，1956年3月，撤销凫山县。
马坡属济宁县。
1958年成立马坡人民公社，同年12月划归微山县。
1966年1月，马坡改建为区，辖7个区，1969年9月恢复马坡公社，1984年4月建马坡乡。
2010年7月撤乡设镇。