清康熙年间属平度州横栾乡和即墨县大兆社辖地；1931年属平度县第七区沙梁镇、洪兰镇、亭兰丘镇；1935年属第七区沙梁镇；1941年平度分三县属平南县洪兰区；1945年1月平南县析出平东县，属平东县洪兰区（第七区），并将大沽河东岸的女儿村、黄家庄、孙家顶、李家庄划入即墨县；1949年10月1日建国时，平东县人民政府驻南村；1953年属平度县第十八区；1956年属平度县南村区；1958年2月撤区并乡属南村乡；1958年秋成立人民公社属南村人民公社；所辖42个自然村，1976年1月大社划小，设立南村公社，所辖36个行政村；1984年春，南村公社改为南村镇。
1994年12月原亭兰乡16个村划归南村镇。
共辖145个行政村。