清初归属阿日本苏木(十佐领)。
民国时期归属罕苏木(庙)区。
1946年6月,建罕苏木(庙)努图克(区)。
1956年6月,罕苏木(庙)努图克(区)改建罕苏木(庙)苏木,并分建巴彦温都尔苏木。
1958年11月,罕苏木(庙)、巴彦温都尔苏木,巴彦包勒格苏木合并建罕苏木(庙)人民公社。
1961年10月,从罕苏木(庙)人民公社分建巴彦温都尔人民公社。
1984年2月,巴彦温都尔人民公社改建巴彦温都尔苏木。
2006年,巴彦温都尔苏木、巴彦包勒格苏木、罕苏木苏木合并建罕苏木苏木。
2012年,从罕苏木苏木分建巴彦温都尔苏木。