红旗满族镇原属盖州市。
伪满洲国时期，镇内各村分属厢黄旗和红旗堡2村。
民国三十四年（1945年）冬，盖平县解放，划归芦屯区。
民国三十五年（1946年），国民党进驻，恢复日伪区划。
民国三十六年（1947年），红旗镇重新划归芦屯区。
1958年6月，成立正蓝旗乡，下设6村，后改红旗公社。
1968年5月，成立革命委员会。
1983年9月，撤公社建红旗乡。
1984年6月，成立红旗满族乡。
1995年12月10日，红旗满族乡撤乡建镇。