赣县在东周前属古扬州。
春秋时处于吴、楚边域。
战国前期处于越、楚边域，后期为楚地。
秦统一后属九江郡地。
汉高祖六年（前201）建县，因《山海经》所记“南方有赣巨人”而得名赣县。
赣县隶属屡经变易，西汉属豫章郡，县治益浆溪。
新莽隶九江郡。
东汉建武元年（25）改九江郡复豫章郡名。
兴平二年（195），孙策分豫章置庐陵郡，赣县属之。
三国吴嘉禾五年（236年）分庐陵郡置庐陵南部都尉，赣县属之。
同年析赣县地置平阳县（太康元年改名平固县）。
西晋太康三年（282年）改南部都尉为南康郡，赣县属之。
太康末(289)县治徙葛老故城(今赣州市章贡区水东一带)。
东晋永和五年(349)，郡、县治徙章贡二水间(今赣州市区)。
刘宋改郡为国，赣县属南康国。
齐复南康郡，梁、陈因之。
陈时赣县与南康县互易名。
隋平陈废郡为州。
开皇九年(589)，因虔化水取名虔州。
同年平固县归并赣县。
隋、唐时期赣县属虔州。
五代杨吴属百胜军。
南唐改昭信军。
宋开宝八年(975)复称州，赣县仍属虔州。
太平兴国七年(982)，析赣县7个乡(原平固县地)置兴国县。
绍兴二十三年(1153)，因“虔”字为虎头，含杀意，非佳名，奏准取章贡二水合流意改称赣州。
元属赣州路。
明、清属赣州府。
民国时期先后直隶省、赣南道、第十一行政区、赣南专区、第九行政区、第四行政区。
1949年8月14日，赣县解放，成立赣县人民政府。
同时析赣州镇设立县级赣州市。
目前，赣县先后隶属赣州分区、赣西南行政区、赣南行政区、赣州专区、赣州地区、地级赣州市。
1969年7月，县城由赣州市徙梅林镇。
2016年10月，江西省政府印发通知，按国务院有关批复精神，同意撤销赣县，设立赣州市赣县区。
以原赣县的行政区域为赣州市赣县区的行政区域，区人民政府驻梅林大街5号（原赣县人民政府驻地）。