明至清初，属扬州府泰州何垛盐场。
清乾隆三十三年（1768年），属扬州府东台县何垛场。
1913年11月，属东台县何垛市。
1940年10月，分属东台县潘丿区和海丰区。
1945年8月，属东台县曹丿区。
1948年7月，属东台县六灶区。
1949年10月，属曹丿区管辖。
1958年9月，划属东台县四灶人民公社。
1959年2月，建立头灶人民公社。
1983年9月，政社分设，建立头灶乡。
1987年7月，撤销头灶乡，以其原辖区域设立头灶镇，属东台县。
2001年7月，撤销头灶镇、六灶镇，将原头灶镇、六灶镇所辖区域合并设立新的头灶镇。
2010年4月，撤销头灶镇、曹丿镇，将原头灶镇、曹丿镇所辖区域合并设立新的头灶镇。