清康熙至同治年间属肖公保，民国36年属杨武乡，1948年归菜园村，1951年推行土改，归菜园乡，1955年推行合作化，为菜园农业合作社，属城关区管辖。
1948年人民公社化，为红星大队，属城关人民公社管辖。
1966年撤社建区，为红星大队，属城关镇管辖。
1975年撤区并社，为红星大队，属城关镇人民政府管辖。
1981年更名为菜园大队，属城关镇人民政府管辖。
1984年撤社并区，撤队改村，为菜园村，属南化区城关镇管辖。
1987年撤区建乡镇，属城关镇管辖。
2003年更名为菜园社区，属城关镇管辖至今。