晚清时期(光绪年间)属石羊乡；民国时期（1923年）隶属第一区（县城）；1937年并区后，属第一区（县城）白鹤乡杨方会;1950年始建钟刘村村公所隶属白鹤乡；1953年成立初级合作社；1957年转入高级社；1958年成立上游（胡金店）人民公社，隶属白鹤管理区白鹤公社钟刘大队；1970年钟刘大队、跃进大队的王杨、吴陈合并改名为长征大队；1981年1月以地命名，因位于三条港的汇合处而改名三港大队；1984年元月设立三港村民委员会，属胡金店区；1987年9月撤区并乡，隶属清明河乡所辖。
2016年3月，三港村改三港社区，属清明河乡所辖。