相传260年前，有薛姓在现址北500米处的薛堰设集；1918年，全县设5区24团，薛集镇属东区7团；1928年，全县设11区，薛集镇属九区巨兴集；1946年，并乡合保，成立保平乡；1949年1月，光化县全境解放后和竹林桥同为第三区（1951年8月改为第五区）；1956年5月与竹林桥分设，建立第五指导组；1958年8月成立薛集乡五星人民公社；1962年1月恢复区制，以驻地更名为薛集区，辖薛集、秦集、齐岗、王岗4个小公社；1975年4月撤区并社时，将小陈营、谢营2个生产大队划归竹林桥人民公社；1985年撤县并市，实行政社分开，薛集公社改为薛集区辖薛集镇、秦集乡、王岗乡、齐岗乡；1987年9月撤区并乡，成立薛集镇和秦集镇；2001年4月，撤销秦集镇，并入薛集镇至今。