清朝同治十年（1871年）全县为4乡，所辖地段属黄陂县崇义乡，民国二十二年（1933年）全县设6区，所辖地段属黄陂县四区，民国二十六年（1937年）全县设四区，所辖地段属黄陂县四区，民国三十四年（1945年）全县划分乡镇，所辖地段属黄陂县尚武乡，1949年所辖地段属黄陂县张家店区光复乡，1952年所辖地段属十四区同兴乡，1955年为红旗、红胜两个合作社归祁家湾区同兴乡管辖。
1958年为红利、红卫两大队；1966年两个大队合并始称红旗；1971年并入红胜的三个自然村，仍称红旗；1980年应重名，以境内原有一座尼姑庵-永昌庵命名为永昌庵大队；1984年改为红旗村，并成立村民委员会至今；1958年属红光人民公社；1959年属祁家湾区；1969年属五岭公社；1986年属土庙镇；2001年土庙镇与祁家湾街道合并后属祁家湾街道。