明清时期属九畹乡，民国时期属九畹乡，设立五保（石柱山、瓦窑坪）；1950年5月设置石柱村，1953年1月改称石柱乡，属第九区（槐树坪）；1956年3月小乡合并后建立照耀、红星、新建、灯塔农业生产合作社，属第五区（杨林）石柱乡；1958年11月人民公社化时设立照耀、红星、灯塔、新建大队，属群力人民公社，1959年3月属群力人民公社石柱管理区；1961年4月设区建社时属群力区石柱人民公社，1975年10月撤区并社后属芝兰人民公社石柱管理区；1981年3月，照耀、红星大队合并为石柱山大队，灯塔大队更名为花桥场大队，新建大队更名为九渡溪大队；1984年2月，石柱山、花桥场、九渡溪大队分别改设为石柱山、花桥场、九渡溪村，属杨林区石柱乡，1987年9月乡镇合并后属芝兰乡；2001年7月，石柱山、花桥场、九渡溪村合并为石柱村，属周坪乡，2009年1月撤乡设镇后属九畹溪镇。