民国初期属由义区管辖。
民国28年属谷城县4区薤北乡管辖。
1949年高庙村属谷城县8区管辖。
1951年属紫金区管辖。
1956年中股岭乡大坡、邵家坪、高庙等村联合成立高级社，取名“联盟社”。
1958年人民公社化时期改名为联盟大队，属紫金公社管辖。
1984年“政社分设”，改名为高庙村，成立村民委员会。
1985年划入薤山林场一分场管辖。
2000年，谷城县薤山旅游度假区成立，高庙村归薤山旅游度假区管辖。
2002年原联运站村、黄瓜河村并入高庙村。