晚清时期，设木瓜河联保，隶属南乡沿观堰三海团。
民国时期设木瓜河乡，隶属杜家川区。
1952年建立新政权，设木瓜乡，隶属桥上区。
1958年人民公社化运动，设木瓜管理区。
1961年改为公社，成立木瓜农业生产大队，隶属桥上公社。
1975年撤区并社，将木瓜、银坪、东蒿、西蒿、杜川五个公社合并为桥上公社。
1984年取销人民公社化体制，设区建乡，成立木瓜村村民委员会，隶属桥上区木瓜乡（1987年改桥上乡木瓜管理区）。
2002年撤销管理区，所辖村合并为木瓜村村民委员会。
2010年桥上乡改名野人谷镇，隶属野人谷镇所辖。