1948年属大隗区管理。
1957年撤销大隗区并乡，建立苟堂、河西、玉皇庙3个小乡。
1958年撤3个小乡合并为苟堂乡，属苟堂乡。
1958年6月属苟堂金星人民公社。
1958年11月属大隗人民公社。
1961年建立樊沟大队，队部驻张家门，隶属大隗管理。
1963年成立苟堂人民公社，樊沟大队属于苟堂人民公社。
1983年撤销樊沟大队选举产生樊沟村民委员会，村部驻后樊沟，属苟堂公社。
同年苟堂人民公社改为苟堂乡后，樊沟村民委员会属苟堂乡。
1997年苟堂乡撤乡建镇后，樊沟村民委员会隶属于苟堂镇，沿用至今。