高村镇辖地，汉元鼎六年（前111年），开始设置端溪县，所辖的高村地带在此之后渐有开发。
东晋末期，设永闻县（即晋化县），高村镇地属县内。
明万历五年（1577年），建东安县，高村镇地属于此。
（在此之前的历史，对高村镇具体地名记载不详。
）清同治年间，设歌村堡。
民国十五年（1926年），改堡为乡，命为高村乡。
1958年9月，并入六都乡；同年10月，成立烘炉人民公社。
1961年3月，设高村镇人民公社。
1983年4月，改为高村区。
1986年10月，设高村镇。
1994年9月，设立云浮地级市后，该镇隶属云城区管辖。
1996年1月，设云安县，该镇为云安县所辖。
2014年9月，云安撤县设区，该镇属云安区管辖。