建制始于明洪武二年（1369）。
清康熙四十四年（1705）设立英德县浛属怀义都流陈图。
清道光十六年（1836）设立流陈乡。
新中国成立后，设立水边乡，隶属于英德县第二区。
1952年3月设立英德县第二区。
1955年8月设立水边区。
1958年9月属跃进人民公社。
1959年4月从跃进人民公社析出设立水边人民公社；同年11月并入西牛人民公社。
1960年从西牛人民公社析出设立水边人民公社。
1983年7月撤社设立水边区公所，1986年11月撤区设立水边镇，沿用至今。
1995年9月划归清远市飞来峡管理区。
2001年10月，从原清远市飞来峡管理区划回英德市。