明嘉靖五年（1526年），三水建县，属胥江都。
民国二十年（1931年），始称芦苞镇。
民国三十五年（1946年），撤销芦苞镇，并归水清乡。
1950年3月，设北区，同年10月，改为二区。
1953年10月，改称六区。
1955年9月，改为芦苞区。
1957年3月，撤区建乡，分为芦苞、同树乡，同年9月，两乡合并称芦苞乡。
1958年10月，成立芦苞上游人民公社。
1961年7月，分为芦苞、同树人民公社。
1963年2月，两社合并为芦苞人民公社。
1984年1月，改为区。
1987年2月，撤区建镇。