4500年前的新石器时代晚期，先民已在今长江镇地域活动。
唐垂拱四年（688年），今长江镇地域属仁化县清化乡。
明代，属仁化县扶溪都。
民国二年（1913年），属仁化县第四区。
1949年10月6日，仁化县解放，正式成立长江乡人民政府。
1950年8月，改称第三区。
1955年6月，改称长扶区。
1957年7月，撤长扶区复设长江乡。
1958年10月1日，改设长扶人民公社。
1980年10月，改设长江人民公社。
1983年11月，改长江人民公社为长江区。
1987年1月，撤长江区设长江镇，仍属仁化县。