清雍正年间（1723-1735），饶平林姓至妈宫后创祖，后来渔民陆续到此居住，形成村落，属福建诏安县云澳区，称中柱乡。
1914年为广东省南澳县第三区中柱乡。
1952年称云澳乡大乡，后复称中柱村。
合作化后称中柱生产大队，1969年改称为中柱村革命委员会，1980年恢复生产大队。
1984年迁至现村委会办公址。
1986年属云澳镇，称中柱村民委员会，1991年改称中柱管理区，1998年改称中柱村民委员会，沿用至今。