明清时，版村属景顺乡文储都。
民国时期，版村属二区文储乡，后文储与安太乡合并称文安乡，后改称民安乡。
建国后，版村属二区民安乡。
1951年12月设版村乡，属高明县二区。
1957年9月划归鹤山县管辖。
1958年设版村大队，属鹤山县双合公社。
1982年高明县恢复建制后，版村大队从原高鹤县双合公社划归高明县更楼公社。
1983年称版村乡，属高明县更楼区。
1987年设版村村民委员会。
1989年称版村管理区，属高明县更楼镇。
1999年设立版村村民委员会，属高明市更楼镇。
2005年高明区部分镇（街道）行政区划调整，改属高明区更合镇。