始建于宋代，至今已有800多年历史。
明代隶属东莞县延福乡第十三都。
清代乾隆以后，隶属中堂司。
1944年分属第六区望溪乡、乌涌乡、马沥乡、治明乡。
1948年，将望溪乡、乌涌乡合并为望联乡，马沥乡、治明乡合并为沥明乡，仍为第六区所辖。
1949年牛墩地属第八区，仍设沥明乡、望联乡，后部分乡入麻涌区，部分乡归中堂区。
1957年，自立为望牛墩大乡。
1958年撤乡属中堂公社。
1959年9月从中堂公社析出，为望牛墩公社。
1983年撤社设区，称望牛墩区。
1987年撤区改镇，称望牛墩镇。