北宋元丰年间(1078年—1085年),属海阳县延德乡。
北宋宣和三年(1121年),从海阳县析出12都建置揭阳县,龙溪属海阳县。
南宋绍兴二年(1132年),潮阳、揭阳并入海阳,龙溪都再属海阳。
南宋绍兴八年(1138年)恢复揭阳县,龙溪属之。
明嘉靖四十二年(1563年),龙溪都从揭阳割归海阳县。
清康熙三年(1664年),斥地,龙溪都被斥出界外。
清康熙(1669年),恢复龙溪都。
民国三年(1914年),海阳县改称潮安县,龙溪都改称龙溪区。
民国十九年(1930年),龙溪区改称潮安县第八区。
民国二十七年(1938年),撤区,第八区中的溪中镇改为庵埠镇。
民国三十四年(1945年),第八区恢复。
民国三十五年(1946年),原第八区分内龙乡和外龙乡。
1949年,内龙乡和外龙乡合并为龙溪区。
1950年3月,龙溪区改称潮安县第八区,同年7月,划出集镇内等地成立庵埠镇,为区级镇。
1953年,撤镇归区,仍在集镇内设置乡级镇,仍称庵埠镇。
1955年5月,第八区改称庵埠区。
1956年2月,原庵埠区地域分为郭陇、刘陇、仙溪、大鉴4乡和庵埠镇。
1956年12月,原庵埠区分为1乡1镇,即刘陇乡和庵埠镇。
1958年4月,并1乡1镇为庵埠镇。
同年9月,庵埠镇改称庵埠公社。
1961年,庵埠公社一分为二,分出刘陇公社。
1962年,两公社合并为庵埠公社。
1966年,从公社划地置庵埠镇。
1983年3月,撤销潮安县,庵埠公社属潮州市。
同年12月,撤公社,置庵埠区和庵埠镇。
1987年,撤区镇,总称庵埠镇。
1992年,潮安县恢复建制,庵埠镇属之。
2013年6月28日,撤销潮安县,设立潮安区,庵埠镇改属潮安区。