薯田埔村前身为白南省龙岗墟，建于清朝嘉庆年间。
1952年10月，宝安县划分7区71乡，薯田埔属第七区公明乡管辖。
1963年2月，撤区并社，薯田埔与马山头合并为公明公社马田大队。
1981年1月薯田埔由公明公社马田大队划分出来成为薯田埔大队。
1993年1月原深圳市宝安县公明镇薯田埔改为深圳市宝安区公明镇薯田埔。
2004年7月，因城市化改制，定名为深圳市宝安区公明街道薯田埔社区，设立薯田埔社区居委会，名称沿用至今，隶属马田街道。