明清时，为平南镇，是秦州所辖十镇之一。
1949年后，在平南设天水县第十二区，下辖平南乡。
1956年，撤区并乡仍为平南乡。
1958年，为兴隆公社平南管理区。
1961年，公社划小后，为皂郊区管辖，设平南、丁家川、黑林3公社。
1966年，将丁家川公社部分大队划归平南公社。
1968年，黑林公社并入平南公社。
1983年，改为乡。
1985年，划归秦城区。
2001年9月，撤乡建平南镇。
2005年1月，归秦州区管辖。