民国初期，沿袭清制，武威县的行政管理区按水系划分为六个渠，即黄渠（黄羊河水系）、大渠（杂木河上游）、杂渠（杂木河下游）、金渠（金塔河水系）、怀渠（西营河上游）、永渠（西营河下游）。
民国24年（1935），将六个行政管理区划分为2个镇、12个乡，属双城乡果园沟保。
中华人民共和国成立初期属双城区九乡，为第三行政村。
1953年属果园乡，为第三行政村。
1956年撤区并乡后属洪祥乡第三高级社。
1958年人民公社化后属双城公社，命名为果园大队。
1962年区划调整后属永昌区洪祥公社，更名为果园大队。
1983年社改乡时设果园村民委员会，属洪祥乡管辖。
2002年9月，洪祥乡撤乡建镇，果园沟村民委员会属洪祥镇管辖。