西汉至十六国“五凉”时期，韩佐镇境域分属武威郡鸾鸟县和姑臧县。
北魏至隋初，属武威郡林中县。
唐宋年间，复归姑臧县。
元时，属永昌路西凉州。
明清时期，先后归凉州卫和武威县。
民国元年（1912年）后，分属武威县古城、大河乡。
1949年9月后，属古城、大河区。
1952年7月，属第九区（古城）、第十区（大河）。
1956年1月，为古城乡。
1958年10月，成立古城公社。
1962年，成立韩佐纭�1983年7月，设韩佐乡。
1986年1月，韩佐乡并入古城乡。
1991年11月，析设韩佐乡。
2018年3月，撤乡，设韩佐镇。