古城村在古雷城内，古雷城始建于明正统六年（1441），明正德十年（1515）重修，为古雷巡检司驻地，也称“古雷社”。
清代古雷保，1916年古雷半岛自港口以南与东山岛，组合成立东山县，1954年为古雷区城下乡。
1955年11月，古雷区7乡划归漳浦县辖，1958年9月属杜浔公社古雷管理区城下大队，1961年7月成立古雷公社，城下大队分为城内、下垵2大队，1981年11月，为区别于同名的湖西公社城内大队、旧镇公社城内大队，经批准更名为古城大队。
1984年9月，撤社建乡属古雷乡（镇）古城村，自命名起沿用至今。