菁城古时属龙岩县九龙乡，为乡驻地。
明清时期及民国初年，为居仁里小菁社。
1934年废里社为第一区菁城镇。
后撤区直属县。
1943年至44年夏，先后纳平春乡、桂华乡，所辖范围相当于现在的菁城、和平（不含和春、春尾、下墘、安靖等村）、桂林、芦芝（不含大深村）等四个乡镇。
新中国成立后，仍为菁城镇，初直隶于县，后属菁华区（第一区）。
1953年分设菁城镇（仅辖旧城墙范围内）、福满乡、顶郊乡。
1957年属菁华督导片，称为城关镇。
1958年公社化后，先后隶红专、菁华、城郊等公社。
1961年为城关公社。
1971年与桂林公社合并为城郊公社。
1980年从城郊公社析出仍为城关镇。
1984年恢复旧称菁城镇。
1995年春，撤镇设街道办事处。