明代属铁石乡在坊里，辖城区南面东山、石粉岭、蔡坑、黄庄及上坪上社的马坑、崎濑等聚落。
清代至民国初，为东山社全境及马坑社、陈陂社的部分区域。
1933年分属西陈区和第五区。
1929年7月至1932年间，境内属马坑区、东山区、山马区苏维埃政府和蕉坑区苏维埃政府辖区；1932年4月10日至10月27日，属南福区苏维埃政府辖区。
1937年3月，属第一区的曹溪、莲山联保及第二区的天和、东浮乡联保。
次年并为曹莲乡联保。
1941年12月，为曹莲乡、东安乡的马濑、王坑、东山、董邦、蔡坑、浮塘保，1942年还包括从漳平县割入象和乡的中甲保。
1944年，辖区为曹莲乡、象和乡的中甲保及第二区的天和、东浮。
1949年11月属西陈区，1956年属附城区，1958年成立溪山、中粉人民公社。
翌年并入城郊公社。
1961年6月从城郊公社分出成立曹溪公社及中甲公社，1965年两社合并称曹溪公社。
1984年7月改曹溪乡。
1989年9月改曹溪镇。
1995年3月，省民政厅批准镇改街道办事处。
2013年1月正式挂牌。