始建于唐朝时期。
明清两朝属归化县归上里六都，1941年为道南乡胡东保肖家山村，1950年为第一区胡坊乡，1954年为胡坊区肖家山乡，1956年明溪和三元县合并为三明县，1958年属三明县上游人民人民公社，1959年属胡坊公社，1964年恢复明溪县胡坊公社肖家山大队，1982年为胡坊区肖家山人民政府，1987年属胡坊乡。
1995年胡坊撤乡建镇后，称胡坊镇肖家山村村委会，名称沿用至今。
2012年被住建部、文化部、财政部联合列入首批“中国传统村落名录”，2015年首批“市级历史文化名村”，2016年为“省级生态村”。