1949年前属周南乡第十四保管辖地。
1951年民主建政时,从第十四保析出置为村,取名青吉村,因析周南乡置石柳乡而随隶。
1953年春,又析石柳乡东南部置英坪乡,村随属。
1958年,废英坪乡入朱砂乡,并改称朱砂人民公社,青吉村也同时改称青吉大队。
随属朱砂公社。
1984年1月,改公社为乡,青吉大队也改称青吉村,隶属朱砂乡。
2001年,朱砂乡划属郁山镇,村随划。
2003年将原青吉村、小河沟村合并为清洁村,同时设立清洁村村民委员会,沿用至今。