明清时期，隶属乐平县怀仁乡水谷都。
民国时期，属皋州乡（三区）。
抗日战争时期，1938年5月，昔阳县分为昔东、昔西两个县，水峪村属昔东县皋落区(三区)。
解放战争时期，1945年9月，昔城解放，两县政府合并为昔阳县，水峪村置昔阳县皋落区（五区）。
1949年-1952年属五区管辖，驻地皋落。
1953年-1957年属水峪乡管辖，驻水峪。
1958年属皋落公社管辖，驻地皋落。
1959年属白羊峪公社管辖，驻北石龛。
1960年属白羊峪公社管辖，驻地白羊峪。
1961年属白羊峪公社管辖，驻北石龛。
1962年-1981年属白羊峪公社管辖，驻白羊峪。
1984年属白羊峪乡管辖，驻白羊峪。
2000年，全县20个乡（镇）合并为12个乡（镇），水峪村归赵壁乡，至今未变。