1949年3月，南通解放后，由团结村、公路村、河东村三个村组成。
1958年9月，南通市东方红人民公社公路社（运河村）、中心社合并为南通市东方红人民公社第六营。
成立第六营时共有中心社9个队，公路社11个队，合计20个队。
公路社（运河村）11个队，即现在的1-10组，另一个队分散掉。
1961年5月，又由第六营分为两个大队。
即中心大队和运河桥大队。
运河桥大队共10个队，即现在的1-10组。
为了生产方便，4队分出了一个队，成了现在的运河13组。
1963年下半年，10队分出了一个队，即现在的运河11组。
1964年航运公司搬走后就给1、2、3组种植，后来建立了12组。
1979年开海港引河后，南通县观音公社8大队3生产队部分村民留在了海港引河河西，后划归了钟秀乡运河村，即现在的14组。
1987年运河桥大队改为运河村，成立运河村村民委员会。
2007年11月，经崇川区政府批准撤销运河村，建立运河社区居民委员会，名称沿用至今。