明朝年间汉江两岸频发大水闹瘟疫，千里无鸡鸣，几乎无人于世，朝廷强行从江西移民，将常、罗、刘、王、秦、曾等姓落户于此，形成村落。
明清时期属于宜城县；1945年3月属自忠县；1949年1月宜城全境解放，周年5月恢复宜城县，属宜城县朱市乡；1956年3月成立农业合作化，小乡并大乡，名石灰，高级合作社属宜城县朱市乡；1958年成立人民公社，名石灰大队，属红旗公社朱市管理区；1961年4月恢复区建制，名石灰大队属宜城县朱市公社；1968年5月“文化大革命”时属宜城县向阳公社石灰大队革命委员会；1974年2月撤区并社，名石灰大队革委会，属宜城县朱市公社；1980年9月撤消革委会成立管委会，名石灰大队管委会，属宜城县朱市公社。
1984年3月撤社建乡，名石灰村属宜城县朱市乡；1986年3月酒厂带队把3、4、5组带走；1988年2月撤乡建镇名石灰村，属宜城县朱市镇；1994年6月撤县设市名石灰村属宜城市朱市镇；2001年3月乡镇合并名石灰村，属宜城市小河镇至今。