西汉武帝初年置孔堤县，隶属武都郡。
1941年2月18日成立孔堤乡，1950年7月建杨坝、仓河、草坝、云雾乡，属杨坝区。
1953年2月增设刘家、柏家、米仓乡。
1955年7月并为观音、杨坝、刘家、秋林、米仓乡，属杨坝区。
1957年并为鱼龙、草坝、米仓乡。
1958年3月并为鱼龙乡，并将大坪、石大坪、小峪寺、李家庙、大鹿院、铺底下、上阴坡等10个高级社划归安化乡。
1958年10月改乡为公社。
1966年10月改名为上游公社。
1980年10月恢复为鱼龙公社。
1983年12月改公社为乡。
1993年10月甘沟门并入王家沟村。
2002年10月石家湾村并入阴湾里村、苟家坝村并入孟家山村、王家坪村并入卯家庄村、赵家湾村并入下尹家村、小碾村并入瓦房村、康宁沟村并入鞍子里村、杨家村并入马坝里村。
2003年设立鱼龙镇。