宝都村自南宋淳熙元年（1174年）杨氏曰益公开基以来，迄今835年，紧跟历代变迁，除小部份子孙因故迁涉外地，余者一直在此繁衍生息，代代相传。
明清时期属龙涓乡，民国时期编制为龙涓乡三乡保，中华人民共和国成立后隶属龙涓区（乡）所辖，合作化、公社化期间改称宝都大队。
1958年属龙涓公社三乡大队，1961年为龙涓区三乡公社宝都大队，1965年撤区及小公社建制，属龙涓公社宝都大队，1984年为龙涓宝都村。
1984年恢复旧称，即宝都村。